Huawei Nova 12 SE memiliki layar OLED 6,67 inci dengan resolusi 1080 x 2400 piksel dan kecepatan refresh 90Hz. Ponsel ini ditenagai oleh prosesor Snapdragon 680 4G dan dilengkapi dengan RAM 8GB serta penyimpanan internal 256GB atau 512GB. Ponsel ini memiliki tiga kamera di bagian belakang, yang terdiri dari kamera utama 108 MP, kamera ultrawide 8 MP, dan kamera makro 2 MP. Kamera depannya memiliki sensor 32 MP, yang mampu merekam video 1080p pada 30fps.
Perangkat ini berjalan pada HarmonyOS 4.0 dan memiliki baterai 4500 mAh dengan pengisian cepat 66W. Perangkat ini mendukung SIM ganda, konektivitas 4G, Wi-Fi 5, Bluetooth 5.0, NFC, dan memiliki pemindai sidik jari yang dipasang di samping. Ponsel ini tidak memiliki jack headphone 3,5 mm tetapi menyertakan USB Type-C 2.0 untuk pengisian daya dan transfer data